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國內外戰略生物資源數字化建設的現狀與進展
1.發達國家高度重視對生物資源的信息化建設和管理
在過去幾十年中,發達國家創建、存儲和連接生物多樣性數據庫的舉措激增。例如,英國國家生物多樣性網絡門戶①是一個收集、分類、分析和傳播英國生物多樣性數據的組織。歐洲建立了生物多樣性數據中心②,愛爾蘭和比利時也倡導了目的類似的國家計劃。長期監測項目,如美國的長期生態研究網絡項目(LTER)④、美國國家科學基金會(NSF)出資?4?億美元建立的國家生態觀測網(NEON)⑤以及澳大利亞的陸地生態系統研究網絡(TERN)⑥等,正在提供長期標準化的生態和生物數據集的開放訪問。更雄心勃勃的國際基礎設施尋求將各國和各大洲的數據庫連接起來。全球生物多樣性信息設施(GBIF)是一個跨國、開放的數據基礎設施,用于匯集當地和不同來源的生物多樣性信息,目前已包括?10?億多條物種分布信息。該設施“允許任何地方的任何人通過互聯網訪問跨越國界共享的關于地球上所有類型生命的數據”。同樣,由美國?NSF?資助的生態信息技術平臺DataONE(地球數據觀測網絡)⑧備受矚目;該項目目標是廣泛收集、存儲地球和環境有關數據,在普及應用基礎上,創造新的知識。
館藏數字化已成為世界自然歷史館藏的關鍵活動之一。通過?NSF?資助推進的生物多樣性數字化(ADBC)項目,美國的保藏物數字化得到了加強。到?2020?年,美國博物館中數字化的標本總數可能超過?1?億件。
近年來,生物多樣性信息學快速發展,全球和區域水平的生物多樣性數據庫不斷建立和完善。若干國家水平的數據庫,如澳大利亞生物多樣性信息系統(ALA) ⑨已有超過?4?606?萬條記錄,美國標本數字化平臺(iDigBio)⑩有超過?9?500?萬條的數字化標本共享。全球生物信息的主要數據由美國的國家生物技術信息中心(NCBI)和歐洲生物信息研究所(EBI)等建立的數據庫控制。
2014?年啟動的世界植物在線(WFO)項目擴大了數字化工作和虛擬植物標本館的范圍。WFO?是根據《全球植物保護戰略》2020?年的主要目標開發的一個與世界其他?30?個機構合作的項目,旨在制作并呈現世界在線植物區系。這些數據通過虛擬植物標本館呈現,并提供給?WFO?門戶網站;所有參與機構將向該網站提供其擁有的數字化植物描述。
2015?年,中國作為代表提出了亞洲生物多樣性數字化計劃(Mapping Asia Plants,MAP)。MAP?旨在建立亞洲植物學信息的大數據在線平臺,為亞洲植物多樣性保護與研究提供綜合性基礎信息和跨學科數據挖掘環境。與MAP?類似的項目為數不多,全球尺度上有?Map of Life(MOL)。MOL?旨在搜集和整合全球物種分布及其動態變化的數據和知識,為生物多樣性教育、保護、研究和科學決策服務。其理念是把生物多樣性畫在圖上(putting biodiversity on the map)。在區域尺度上,植物學信息與生態網絡(Botanical Information and Ecology Network,BIEN)提供了很好的參考案例。
2. 我國積極推動科技資源的整合共享與高效利用
為促進科技資源的有效利用和共享,我國科學技術部啟動了國家科技基礎條件平臺建設工作。自然科技資源和科學數據共享服務屬于平臺建設的主要內容,植物種質資源、動物種質資源、微生物菌種資源、人類遺傳資源、實驗生物材料、生物標本、巖石礦物和化石標本等八大類自然資源的整合集成與共享成為自然科技資源平臺建設的重點??茖W數據資源建設重點整合、集成各部門、各地方、各單位的科學數據資源,充分利用國際科學數據資源,搶救離散科學數據資源,開發系列數據集和產品,構建面向全社會的網絡化、智能化的科學數據管理與共享服務體系。
2018?年?2?月,為深入實施創新驅動發展戰略,規范管理國家科技資源共享服務平臺,推進科技資源向社會開放共享,科學技術部、財政部印發《國家科技資源共享服務平臺管理辦法》。2018?年?4月,國務院辦公廳印發《科學數據管理辦法》,對戰略生物資源數據的規范管理具有重要的指導意義。2019?年?6?月?5?日,為落實《科學數據管理辦法》和《國家科技資源共享服務平臺管理辦法》的要求,規范管理國家科技資源共享服務平臺,科學技術部、財政部對原有國家科技資源共享服務平臺開展了優化調整工作。通過部門推薦和專家咨詢,形成“國家微生物數據中心”等?20?個國家科學數據中心以及“國家重要野生植物種質資源庫”等?30?個國家生物種質與實驗材料資源庫。